WHO最新MPD分类包括如下7类：CML（Ph染色体即t（9；22）和BCR/ABL阳性）、CNL、CEL（和HES）、PV、IMF（伴髓外造血）、ET和CMPD（不能分类型）。自从发现了Ph染色体、t（9；22）和BCR/ABL，特别是酪氨酸激酶抑制剂应用于临床后产生了BCR/ABL阳性和阴性MPD的新概念和新分类方法。目前临床上所指的MPD通常为反映多能造血干细胞转化的PV、IMF和ET3种为主。