肝炎合并血液系统病变较为多见,其机制为病毒直接侵害骨髓干细胞,导致其基因损害和变异。也可通过自身免疫反应使血液细胞受损而遭到破坏，特别是乙肝患者，发生血液系统疾病的几率较高，实验观察到乙肝病毒可选择性的侵犯有核红细胞使其数量减少，在对肝炎患者作白细胞培养时，可见多种染色体异常，细胞有丝分裂受抑制，其结果是影响细胞的分化和生存能力。另外，肝脏和骨髓的某些细胞成分属同样的来源，可能具有相同的抗原，当肝炎发生自身免疫反应时，肝脏和骨髓可同时受累，临床上多见的有血小板减少、白细胞减少、贫血、再生障碍性贫血和溶血性贫血。
肝炎化患者常有脾大、脾功能亢进，导致血细胞破坏增多，也可引起血小板、白细胞减少，严重的可有红细胞、白细胞、血小板三系减少